额济纳旗（蒙古语：ᠡᠵᠡᠨᠡ
ᠬᠣᠰᠢᠭᠤ，西里尔字母：Эзнээ хошуу）是中华人民共和国内蒙古自治区阿拉善盟辖下的一个旗。
在古代为草原丝绸之路常经之地，也是西汉至唐朝河西走廊的军事战略要地。西汉时汉武帝开始往这里大量迁徙移民，实行屯垦戍边，成为汉匈双方交战的前哨营垒。从公元前102年（太初三年）起，从内地迁徙到这里屯戍的广大军民在强弩都尉路博德的带领下，开垦了数万亩良田、修筑了数百个城障亭燧，形成了攻防一体的居延边塞，史书上统称其为“遮虏障”。西汉政府对居延边塞的经营持续了120多年。出土的居延汉简是汉代军民屯戍活动的文书档案。王莽时期将居延改为“居城”，属辅成郡（今酒泉）管辖。公元73年（永平十六年），汉明帝派遣窦固和驸马都尉耿秉出居延塞北伐匈奴。公元91年（永远三年）大将军窦宪遣左校尉耿夔出居延，在金微山大破北匈奴，北匈奴从此破散迁往中西亚地区。东汉汉献帝建安年间（公元196——220年）改张掖居延属国为西海郡，治所仍设在居延城，辖居延一县。
西晋时期，居延地区仍沿袭西海郡建制。公元282年（太康三年），西海郡有居民2500多户。301年（永康二年），居延地区仍归属凉州（今甘肃武威）管辖，晋惠帝封任的凉州刺史兼领护羌校尉张轨治所姑臧（今武威），大量汉人流民涌入，形成了前凉割据政权。到张骏﹑张重华父子统治时期（公元324——353年），西域诸国先后归附，前凉达到鼎盛阶段，其疆域“南逾河﹑湟，东至秦﹑陇，西至葱岭，北暨居延”。
376年，前秦主苻坚派遣步骑13万大举进攻姑臧，前凉政权灭亡。385年九月，前秦大将吕光征伐西域回到凉州，遂割据凉州自称凉州刺史、护羌校尉、酒泉公。公元386年九月，得知前秦王苻坚已被后秦姚苌所杀后，于386年十月吕光宣布改元太安，建立后凉政权，设都姑臧。西海郡居延边塞守将王桢反叛。386年，吕光之弟吕宝率领后凉军队攻下居延城池后，将这里的居民迁徙到河西走廊，后又迁往乐都。先后隶属北凉、西凉、北魏、西魏、北周等。418年，北魏帝拓跋嗣自长川诏护漠北高车中郎将薛繁率众北略，至弱水，降者两千余人，获牛马二万余头。北魏时西海郡被废，后迁址到敦煌附近重新设置。521年，漠北柔然主婆罗门因高车部所逐，率十部落由居延古道入凉州归降，上书请求修理居延西海郡旧城，赐其居住。北魏帝肃宗诏准。柔然部众的投降“遂使阴山息警，弱水无鏖。”后婆罗门由居延叛投噘哒，居延遂空，重陷荒芜。544年，突厥图门始至塞上市缯絮，西魏宇文泰达酒泉途经居延使其国。公元556年，突厥经居延，假道凉州，与西魏合兵破吐谷浑于青海。561年北周在居延地区设置了军事机构“同城戍”，驻地就在“大同城”，位于达来呼布镇东南19公里处，东距黑水城5公里，城墙由内外两道组成，因其外观形似马圈，遗址内积有马粪，故今也称马圈城。583年（隋文帝开皇三年）隋朝在此置同城镇，归西凉州管辖。公元609年（大业五年），又在居延地“谪天下罪人配为戍卒，大开屯田，发四方诸郡运粮以给之”。627年 (贞观元年)，回纥酋长菩萨沿居延道路至马鬃山，协助唐朝军队大破突厥酋长欲谷设，迫其至天山。后在居延设同城守捉。公元686年（垂拱二年），唐廷遣左豹韬卫将军刘敬同发河西骑士出居延海平定同罗、仆固之叛，迁置“安北都护府”于同城纳降突厥。公元743年（天宝二年），在此设置 “宁寇军”统领居延军务，有士卒1700人，马500匹。
唐代宗大历（公元766年）之后，居延地区先后为吐蕃、回鹘、契丹所占据。隋唐时期设立的大同城、同城镇因战乱被最终废弃。
西夏时为进一步消除后顾之忧，防卫吐蕃和回鹘进犯，1036年西夏开始向额济纳地区实行移民屯戍，修筑黑水城。城池建成后，又在这里设置了黑水镇燕军司称。黑水城，额济纳乃党项语称呼，这座城市也是当今世界现存的唯一一座以党项语命名的城市。1226年西夏黑水城被成吉思汗率领的蒙古大军攻破。
1286年（至元二十三年）元世祖忽必烈为讨伐海都之叛，解除西北方面的威胁，在此设有亦集乃路，属甘肃省。统辖这一地区及西宁、山丹两州。“亦集乃”为党项语，意为黑水。1372年六月十一日，傅友德率明朝军队兵临城下，元朝亦集乃城守将卜颜帖木尔献城投降，随即城池遭焚毁，弱水改道，居民尽被迁往河西走廊，此后这里成为明朝边外的战乱荒芜之地。
清代额济纳土尔扈特旗在此游牧。同治年间回民武装攻入额济纳旗，迫使当地的土尔扈特人逃往外地避难近十年之久始返故土。
根据第七次人口普查数据，截至2020年11月1日零时，额济纳旗常住人口为35756人。
额济纳旗下辖2个街道办事处、3个镇、6个苏木：航空街道、东风街道、达来呼布镇、东风镇、哈日布日格德音乌拉镇、策克镇、赛汉陶来苏木、马鬃山苏木、苏泊淖尔苏木、巴彦陶来苏木、温图高勒苏木和巴音陶海苏木。
额济纳旗和甘肃省长期存在领土划界纠纷，曾发生过2015年额济纳旗检查站砸毁事件。
达（达来库布镇）银（银川）线。
还可以从蒙古国通过西伯库伦口岸进入。
临哈铁路、清绿铁路、嘉策铁路贯穿全境。有客运列车在呼和浩特与达来呼布间往返。
额济纳旗桃来机场于2013年12月17日通航。目前有幸福航空和中国东方航空来往阿拉善左旗和西安的定期航班。
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